​​Mercedes Muñoz ha centrado su investigación la regulación audiovisual, especialmente en cuestiones como la redefinición del servicio público audiovisual y la puesta en marcha de nuevos instrumentos de autorregulación y corregulación. Entre sus publicaciones:”Key issues to understand the controversy surrounding the economic support os Spanish public television”, Communication&Society, 14.“El futuro jurídico de la televisión desde una perspectiva europea”, Marcial Pons, Madrid 2006.